Одна из самых известных достопримечательностей Санкт-Петербурга, Петропавловская крепость почти два века (с начала XVIII по начало XX) являлась тюрьмой.
В 1769 году на территории Алексеевского равелина Петропавловской крепости была построена деревянная тюрьма, позже заменённая на 20-камерную каменную тюрьму. Там содержались декабристы, петрашевцы и другие политические узники. В конце XIX века эта тюрьма была снесена, а заключённые были переведены в Шлиссельбургскую крепость (Орешек).
В 1872—1921 годах в Петропавловской крепости действовала и тюрьма Трубецкого бастиона. В этом двухэтажном пятиугольном здании в одиночных камерах содержались обвиняемые в политических преступлениях — от царевича Алексея до Максима Горького. До 1917 года через тюрьму прошли около полутора тысяч заключённых. В настоящее время это музей.

Древняя русская крепость, расположенная на Ореховом острове в истоке Невы. В начале XVIII века она начала использоваться как политическая тюрьма. В начале XX века здесь содержались эсеры и народники, некоторые из них были казнены. В период Великой Отечественной войны внутренние постройки серьёзно пострадали. Сейчас крепость является музеем.

Эта тюрьма действовала до 1883 года на территории Соловецкого монастыря и имела дурную славу из-за сурового режима. Сюда свозили политических и церковных узников, которые содержались в тесных камерах. Правда, за многовековую историю здесь побывали всего около пятисот заключённых. Сейчас Соловецкий монастырь является объектом культурного наследия.
В советское время (1920—1930-е годы) на Соловецких островах действовал Соловецкий лагерь особого назначения (СЛОН), куда направляли в том числе политических заключённых. Он послужил основой для возникновения ГУЛАГа.
По словам исследователей, осенью 1937 года более тысячи заключённых были вывезены с Соловков в Сандармох и расстреляны. Позже в память об узниках ГУЛАГа в разных городах были установлены Соловецкие камни, а на самом Соловецком острове работает музей-заповедник.

Бывшая каторжно-пересыльная тюрьма, построенная в середине XIX века. Во времена СССР была одной из самых строгих тюрем; в годы Большого террора здесь расстреляли 2,5 тысячи человек. Сейчас в тюремном замке функционирует музей сибирской каторги и ссылки.

Исправительно-трудовая колония строгого режима, а ныне — мемориальный музей-заповедник истории политических репрессий в Пермском крае. До 1972 года здесь содержались осуждённые сотрудники правоохранительных органов, затем — осуждённые за особо опасные государственные преступления. Через колонию прошло много диссидентов: Владимир Буковский, Юрий Орлов, Натан Щаранский и другие.

Бывшая тюрьма в Нижнем Новгороде, построенная в начале XIX века и упразднённая в 1914 году. Здесь находились не только уголовные, но и политические заключённые — например, писатели Максим Горький и Владимир Короленко. В советское время тюрьма использовалась под различные нужды. В настоящее время по острогу проводятся экскурсии.

Мемориальный музей в Томске, расположенный в подвальном помещении здания, где с 1923 по 1944 годы находилась внутренняя тюрьма Томского городского отдела ОГПУ-НКВД. В экспозицию входит тюремный коридор, камеры для подследственных, интерьер кабинета следователя. Музей участвует в реализации проектов по увековечиванию памяти жертв политических репрессий.

Этот следственный изолятор, построенный при Екатерине II и позже ставший пересыльной тюрьмой, продолжает работать и поныне. Но музей при тюрьме был создан ещё в 1971 году. Он расположен на третьем этаже Пугачёвской башни. Через Бутырку прошло множество политзаключённых: Сергей Королёв, Александр Солженицын, Варлам Шаламов и другие. В годы Большого террора тысячи арестантов были расстреляны.

Петербургская тюрьма «Кресты» была построена во второй половине XIX века. Здесь содержались советские политические, военные и культурные деятели. Музей на территории изолятора был открыт в 1993 году. В 2017 году здание на Арсенальной набережной перестало функционировать в режиме изолятора, затем некоторое время там располагалась колония-поселение. Позже тюрьму окончательно вывели из структуры УИС; по состоянию на март 2023 года музей уже не функционирует.

Музей в СИЗО Иркутска. Через иркутскую пересылку, основанную в 1805 году, проходили арестанты, отправленные на заключение в Якутию, Забайкалье и Восточную Сибирь. До революции это была самая многочисленная тюрьма в России. Последние недели жизни перед расстрелом (7 февраля 1920 года) здесь провёл адмирал Александр Колчак. Сейчас его камера является частью экспозиции. По неофициальной версии, Колчак был расстрелян прямо в стенах этой тюрьмы, а не на берегу реки.